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母子之間是可以做親子鑒定的。

母女或母子和父子或父女鑒定都是一樣的，都是二聯體親子鑒定。且在計算母權指數與父權指數也是一樣的。判斷標準也是一樣的，都是需要滿足所檢測的人類基因位點符合遺傳規律且累計母權指數（父子或父女鑒定為父權指數）大于9999。

由于DNA的突變概概率在1.4%左右，盡管親代到子代遺傳的過程中會發生基因突變的現象，當發生突變時一般需要增加基因位點或是提供另外未參與方樣本做三聯體親子鑒定，但是親代到子代遺傳過程中的大部分突變現象的發生都是在父子或父女之間，母女或母子目前還沒有為案例出現（不排除有可能出現的現象）。
母女或母子鑒定相對于父子或父女鑒定要少很多，個人親子鑒定中一般是懷疑醫院報錯孩子確認一下或找到丟失的孩子的確認一下，司法親子鑒定中一般是非婚子與母親做親子鑒定落戶到母親的戶口所在地（政策上一般是有2016年1月1日出生的孩子隨母親落戶有出生醫學證明就可以上戶，有異議的就是非婚生子的需要做司法親子鑒定落戶），或是孩子隨母親改嫁落戶到男方的戶口所在地，或是有孩子有隨母親出國的需要。

更多詳情：上海親子鑒定中心