親子鑒定中在對人類遺傳基因座檢測分析兩者間的親子關系時，三個以上不符合遺傳規律的才能判定為非親生關系的。
當親子鑒定判定親子關系時一個位點不符合遺傳規律的，一般是需要加做母親的樣本做父母子三聯體親子鑒定，或父子兩人同時增加檢測到40位點來進一步確認親子關系。一般加測后都是親生關系的。如果一個位點對不上是非親生的話，那么這兩個人一定是近親了。在親子鑒定判定親子關系時，是需要在排除同卵多胞胎、近親及外源干擾的前提下，做最后的判定。所以在親子鑒定時，都是否定的是100%排除親子關系，肯定的是親權概率大于99.99%的判定親子關系，肯定理論上無法達到100%的，只是無限接近100%，肯定的達到100%判定的前提條件是假定父、假定子的兩個人需要排除特殊情況。
親子鑒定中結果是親子關系的絕大多數情況下，是所有位點都符合遺傳規律的，但是為何會有一個基因座位點不符合遺傳規律的呢？這種現象在遺傳學上被認為是基因突變。基因突變一般都是外界環境的影響才發生的。在判定基因突變的時，在親子鑒定中若某一個基因座位點發生突變時，大部分某個基因座位點在遺傳過程中發生一個堿基的增加或減少，特殊情況在遺傳過程中發生兩個堿基的增加或減少，兩個堿基的增加或減少就已經很罕見，超過兩個的或是更多的就很難發生。所有輕微的突變是存在的，如果堿基重復數相差很大，那就不是基因突變現象，那就是不符合遺傳規律的。
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