日本于處理親子關(guān)系事件時，兼采家事調(diào)解及審判解決親子紛爭， 僅僅約一成的案件進行
親子鑒定。多數(shù)案件均能經(jīng)由調(diào)解程序中調(diào)解委員及家事調(diào)查官的努力，消到紛爭并展開新的親子生活。
由此觀之，DNA鑒定在親子關(guān)系事件的處理上，應有其限制。過去科學鑒定技術(shù)尚不發(fā)達時，法院采取事實上推定的方式，依據(jù)經(jīng)驗法則就間接事實推認親子關(guān)系的存在與否。在長年判例及學說的累積之下，間接事實中除了客觀上推論血緣關(guān)系的間接事實外，并包括了當事人主觀上為父母的意思及社會生活的事實(例如無積極證明生母性關(guān)系紊亂的情形)，可以經(jīng)由法官在具體個案的判斷，某種程度兼顧未成年子女的利益。然而，在DNA鑒定技術(shù)發(fā)達的現(xiàn)在，臺灣地區(qū)親子法在科學技術(shù)發(fā)展的背景下，雖已慢慢傾向采取生物學上的真實主義，卻未意識到法律應具有其獨自的價值判斷。雖然科學上的真理是一個可以信賴的價值，但是親子關(guān)系中親情的表現(xiàn)與養(yǎng)育的事實，也具有重要的價值而不可偏廢。
是故，在運用DNA鑒定(勘驗)作為證據(jù)方法時，其證據(jù)能力上首須考量隱私權(quán)及家庭和平的保護，認為違反當事人意愿所取得的血緣鑒定報告不得采為證據(jù)(例如夫懷疑其子女為妻與他人所生，以哄騙方式帶年幼之子女至醫(yī)院鑒定親子關(guān)系)。而在檢驗報告的證據(jù)力上，則應限制鑒定人的資格及鑒定標準程序，建立完備的衡量標準。
